Σε έγγραφο του 1409 αναφέρεται πως ο Πρώτος του Αγίου Όρους Σίμων, παραχώρησε στο μοναχό Θεόδουλο, ηγούμενο της Ιεράς Μονής Αγίου Παύλου, το Κελλί του Σωτηριώτου, που ανήκε στο Πρωτάτο. Σε έγγραφο του 1423 ο ιερομόναχος Ευθύμιος ζήτησε και πήρε από τον Πρώτο Γεννάδιο το Κελλί του Θεοδόχου Συμεών, το επονομαζόμενο του Φιλογόνου, στην περιοχή των Καρυών, που ανήκε στο Πρωτάτο. Η Μονή επέστρεψε το Κελλί στο Πρωτάτο το 1456, σύμφωνα με έγγραφο του Πρώτου Σεραπίωνος. Το έτος 1661, η Μονή αγόρασε τέσσερα Κελλιά στις Καρυές. Σήμερα υπάγονται σε αυτή τρία Κελλιά στις Καρυές: α) του Αγίου Ανδρέα, που είναι το σημερινό Αντιπροσωπείο της, με ομώνυμο παρεκκλήσιο. Το 1867 πούλησε το Κελλί στον Μητροπολίτη πρώην Μοσχονησίων Καλλίνικο ο υποτακτικός του ιερομόναχος Ευθύμιος, όπου εκοιμήθη και ετάφη στις 13-9-1891. Η Μονή αγόρασε ξανά το Κελλί το 1895. Εργασίες προστασίας και ανακαίνισης έγιναν το 1992 και 1993. β) το Κελλί των Αγίων Θεοδώρων, εκατό μέτρα βορειοδυτικά του Αντιπροσωπείου, όπου επίσης έχουν γίνει σημαντικές εργασίες επισκευής και συντήρησης των εσωτερικών χώρων του. Υπάρχει μαρτυρία πως το 1824 η Μονή αναγκάστηκε να το πουλήσει λόγω δυσβάσταχτων χρεών της. γ) το Κελλί της Υπαπαντής, για το οποίο σε έγγραφο του 1456 αναφέρεται ότι ο Πρώτος του Αγίου Όρους Σεραπίων το παραχώρησε στον ιερομόναχο Ιάκωβο και τους άλλους μοναχούς. Υπάρχει ωστόσο και παλαιότερη αναφορά, του 1423, σε έγγραφο του Σέρβου δεσπότη Στεφάνου, που αναφέρεται ως Κελλί του Αγίου Συμεών του Θεοδόχου, το επιλεγόμενο του Φιλογόνου, που ταυτίζεται με το Κελλί της Υπαπαντής και παραχωρήθηκε από τον Πρώτο του Αγίου Όρους, ιερομόναχο Μαλαχία. Τη δεκαετία 1880-1890 το Κελλί ανακαινίσθηκε εκ βάθρων.
