Δεύτερος σημαντικός σταθμός στην ιστορία του μοναστηριού υπήρξε η άφιξη στο Άγιον Όρος το 1078 ενός σημαντικού Βυζαντινού αξιωματούχου που ήθελε να ασπασθεί τον μοναχικό βίο, του μεγάλου δρουγγαρίου της βίγλας Στεφάνου. Ο Στέφανος καταγόταν από επιφανή οικογένεια των Αθηνών και διέθετε σημαντική περιουσία. Παρέλαβε από τον Πρώτο του Αγίου Όρους τη Μονή, δίνοντας μάλιστα ένα σεβαστό χρηματικό ποσό για τη συντήρηση του ναού του Πρωτάτου στις Καρυές, και εγκαταστάθηκε σ’ αυτήν μαζί με τους τρείς ακολούθους του. Έγινε μοναχός με το όνομα Συμεών και ανέλαβε την ηγουμενία της σχεδόν ερειπωμένης μονής. Επιδόθηκε σε σημαντικό ανακαινιστικό έργο, γεγονός που τον κατέστησε νέο κτήτορά της.
