Η Βιβλιοθήκη της Μονής στεγάζεται σε ασφαλή χώρο στη νοτιοδυτική πλευρά και αποτελείται από χειρόγραφα και έντυπα βιβλία. Ειδικότερα, περιλαμβάνει περίπου 550 χειρόγραφα, εκ των οποίων 8 περγαμηνά και τρία λειτουργικά περγαμηνά ειλητάρια. Μεταξύ αυτών σημαντικός είναι ο αριθμός των μουσικών χειρογράφων, ενώ αρκετά από τα νεώτερα χειρόγραφα, κυρίως ακολουθίες, δεν είναι ακόμη γνωστά στο ευρύ κοινό, αφού δεν έχουν περιληφθεί στους έντυπους καταλόγους που έχουν κυκλοφορήσει. Στο χώρο της Βιβλιοθήκης φυλάσσονται, επίσης, περίπου 15.000 έντυπα βιβλία, παλαίτυπα και νεώτερα βιβλία. Η Μονή διαθέτει μία από τις μεγαλύτερες συλλογές παλαιτύπων στο Άγιον Όρος σήμερα.
